Das Plugin MinimizeToTray ist derzeit nicht mit Thunderbird 3.0 (beta 3) kompatibel. Wenn man das Plugin jedoch trozdem benutzen möchte lässt es sich mit einem einfachen Trick kombatibel machen und läuft danach astrein.
– Zunächst muss die xpi Datei des Plugins heruntergeladen werden. Diese findet man z.B. hier.
– Nach dem herunterladen reicht nun einfaches Dateiendung ändern von .xpi in .zip um sie mit winzip oder einem ähnlichen Programm öffnen zu können.
– in dem nun vorhandenen Archiv heist es nun die install.rdf mit einem einfachen Texteditor (wie Windows notepad) zu öffnen.
– in der nun sichtbaren datei findet man in dem Abschnitt

<em:targetApplication>
<!– Mozilla Thunderbird –>

die Zeile:

<em:maxVersion>2.0a1</em:maxVersion>.

Diese Zeile muss nun verändert werden. Am einfachsten ist es sie in ein

<em:maxVersion>4.0a1</em:maxVersion>

zu ändern (ist zwar etwas übertrieben, aber in dem nun vorhanden Versionsintervall liegen def. alle zukünftigen Thunderbird 3.x Versionen „drinne“).
– Datei speichern und wieder in das Zip archiv reinkopieren (alte datei überschreiben).
– Die .zip datei wieder in .xpi umbenennen und wie gewohnt installieren.

Das ganze funktioniert vermutlich auch mit vielen anderen Plugins sowie vielen Firefox Plugins.
Update:
funktioniert auch getestet mit Zindus unter Thunderbird 3b4